НДФЛ и взносы схлопнутся после заполнения и проведения уведомления. А 68.12 отредактируйте в документе Списание с расчетного счета. И вот здесь как раз важно сделать начисление. Операции - Единый налоговый счет - Операции по счету - Операции - Налоги – Начисление. Д 68.12 (или любой другой субсчет, по которому Уведомления не подаются, НДС, например) К 68.90.

Я хочу скорректировать еще ответ коллеги выше. Немного не так насчет заполнения Уведомления, когда декларация еще не сдана по срокам. Уведомление заполняется, когда его необходимо представить в налоговую на основании п. 9 ст. 58 НК, т.е. если срок уплаты налога, установленный НК раньше, чем срок подачи Декларации, установленный НК, либо Декларация не подается вообще, при этом не имеет значения, когда фактически платите налог и подаете Декларацию.

А Операция заполняется в том случае, если Уведомление подавать не надо, например, НДС, Налог на прибыль, годовой налог УСН.

я тоже с таким столкнулась. Еще долго думала, где посмотреть, каким образом распределяется ЕНП в 1С на счете 68.90 в счет конкретных налогов (взносов) по сроку уплаты – оказалось, что просто надо было выбрать Периодичность – По дням. Еще для меня было в новинку, что у счета 68.90 нет ни одного субконто, то есть аналитический учет по нему ведется только с помощью специальных регистров.

По дебету счета 68.90 будет отражаться перечисление ЕНП с расчетного счета налогоплательщика, а по кредиту будет отражаться исполнение обязанности по уплате налогов. Это значит, что по кредиту счета 68.90 будет отражено каким образом ЕНП распределился по налогам и взносам. Чтобы отразить перечисление денежных средств на ЕНС с помощью ЕНП, необходимо воспользоваться платежным поручением.

В дополнение к выше написанному: для отражения уплаты налога с помощью ЕНП нужно провести документ Списание с расчетного счета. Он делает проводку Дт 68.90 – Кт 51.