Лучше, когда в базе сохраняются все документы. Соблюдается порядковая нумерация. Методологически правильно корректировать созданный ранее документ. К сожалению, в УТ 10.3 возврат в отчете комиссионера о продажах не предусмотрен. Рекомендовано вернуть товар на склад комиссионеру про помощи Корректировки записей регистров. Провести сторно возвращенных позиций и оформить возврат.

Есть еще варианты: Доработка функционала или переход на более современную версию программы. Решать Вам.

Возврат товаров достаточно частая ситуация, причин много: при приёмке товаров было обнаружено расхождение фактического количества с заявленным в накладной; товары оказались бракованными; товары оказались невостребованными и т.д.
В более современных версиях программы для отражения возврата достаточно на основании ранее введённой реализации ввести документ «Возврат товаров от покупателя». Возврат товаров от комиссионера оформляется аналогично, возврату товаров от клиента. Созданный документ Вы сможете увидеть в разделе Продажи - Документы возврата. При создании документа Вы можете указать способ определения себестоимости: равна сумме в данной строке; определяется из документа продажи; указывается вручную. Легко и просто.